活性定义:
用活性化的大马哈鱼精子DNA作为模板/引物,在74℃,30分钟内,将10 nmol脱氧 核苷酸掺入到酸性不溶物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。
质量控制:
经过多次柱纯化,SDS-PAGE检测其纯度大于99%;经检测无外源核酸酶活性; PCR方法检测无宿主残余DNA;能有效地扩增人基因组中的单拷贝基因;室温存放一个月,无明显活性改变。
使用方法:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1. PCR反应体系:
试 剂 | 50 μl体系 | 终浓度 |
10×Pfu PCR Buffer | 5 μl | 1× |
dNTP Mix,10 mM each | 1 μl | 200 μM each |
Forward Primer(10 μM) | 1-2 μl | 0.2-0.4 μM |
Reverse Primer(10 μM) | 1-2 μl | 0.2-0.4 μM |
Template DNA | <1 μg | <1 μg/reaction |
Pfu DNA Polymerase, 2.5 U/ μl | 1 μl | |
RNase-Free Water | up to 50 μl |
注意:
1)用Pfu酶扩增时,引物的纯度要求较高,引物长度大于18个碱基,引物浓度请以终浓度 0.2-0.4 μM作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。
2)镁离子浓度请以终浓度1.5-3 mM作为设定范围的参考。本产品的10×Pfu PCR Buffer中已经含有20 mM镁离子,可根据不同的引物对和模板来调节镁离子浓度,由此优化反应体系。
2. PCR反应条件
步骤 | 温度 | 时间 |
预变性 | 94℃ | 2min |
变性 退火 延伸 |
94℃ 55℃-65℃ 72℃ |
30S 30S 60S * |
终延伸 | 72℃ | 5min |
* 延伸时间可以根据产物大小调整,Pfu DNA Polymerase扩增速度为1kb/min
注意:
1)Pfu酶的热稳定性比Taq酶好,对于GC含量很高的模板,变性温度可以提高到98℃,对Pfu酶的活性无影响。
2)一般实验中退火温度比扩增引物的熔解温度Tm低2℃,无法得到理想的扩增效率时,适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度,由此优化反应条件。
3)Pfu酶具有3′-5′外切酶活性,所以Pfu酶扩增时延伸速度远比Taq酶低,延伸时间根据所扩增片段大小设定,本产品的扩增延伸速率为1 kb/1 min,根据目的片段大小可以适当更改延伸时间。
4)可根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非特异性背景严重。所以在保证产物得率的前提下应尽量减少循环次数。
5)本产品具有3′-5′外切核酸酶活性,PCR产物3’端不带“A”,不能直接用于T/A克隆,如需进行T/A克隆则需要在其末端添加“A”或用平末端载体进行克隆。
3. 结果检测:反应结束后取5 µl反应产物,加入适量上样缓冲液后,进行琼脂糖凝胶电泳检测。